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MIRNA pulldown

原理:miRNA pulldown这种方法,其主要流程是将生物素标记的 miRNA 转入胞内,让其与 靶基因mRNA形成蛋白复合物(miRNP),再利用链霉亲和素磁珠与生物素基团的互作捕获miRNA-mRNA 复合体。此后,将所捕获的复合体中的 miRNA 以及与之结合的靶基因 mRNA纯化出来,最后通过芯片检测或者高通量测序检测鉴定纯化得到的靶基因mRNA,即为此 miRNA 的靶基因mRNA。

应用:

miRNA功能机制研究:现在芯片或者高通量测序技术已经能大规模研究miRNA,然后通过功能研究筛选出我们感兴趣的miRNA,但是这些miRNA的靶基因寻找还是一个难题,虽然有预测软件可以预测miRNA的靶基因,然而很多研究也表明预测软件的预测结果往往不准,miRNA pulldown技术体系能通过实验的办法直接回收miRNA靶向结合的RNA,所以miRNA pulldown技术体系非常适合寻找miRNA的靶基因研究。