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真核无参转录组测序

真核有参转录组测序
真核无参转录组测序

基于Illumina 测序平台,真核无参转录组测序采用Illumina Hiseq平台,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序,拼接出最长的转录本为unigene,以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释,全面分析基因表达水平和结构信息。

实验流程:
应用方向:
技术优势:

生物领域各个研究方面,如:


◆ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;


◆ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

◆ 样品类型广泛:动植物组织、微生物、细胞、外泌体等


◆ 质控严格:严格的质量控制,及时与客户沟通RNA质检结果


◆ 平台优,数据质量高:基于优质的Illumina测序平台,建库成功率>98%,数据质量高,Q30>85%


◆ 分析内容丰富:个性化分析,联合分析,分析内容更丰富

据分析:

转录本拼接组装

基因表达水平定量

基因功能注释(7大数据库)

样品间相关性分析

CDS预测

基因差异表达分析

SNP分析、Indel分析

差异表达基因功能富集分析

SSR分析

差异表达基因的蛋白质互作网络分析

转录因子注释

个性化分析