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TMT

Label free 蛋白质组
DIA蛋白质组学
4D-DIA定量蛋白质组学
TMT
iTRAQ
4D-label free 定量蛋白质组学

TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术，采用6、10及16种同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，经高分辨质谱仪串联分析，可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量，是定量蛋白质组学中经典的高通量筛选技术。

实验流程：
技术优势：
应用方向：

◆ 同一批次标记的样本统一处理，减少样本处理及实验误差，实验平行性较高


◆ 同一批次标记定量稳定性高


◆ 通过分级方法可深度可大大增加蛋白鉴定深度

生物领域各个研究方面，如：


◆ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；


◆ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；


◆ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；


◆ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。

数据分析：


标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图

差异蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析内容

WGCNA共表达分析

获得与表型强关联的核心蛋白质

趋势聚类分析

探讨蛋白质的表达趋势模式