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iTRAQ

iTRAQ
TMT
4D-DIA定量蛋白质组学
Label free 蛋白质组
DIA蛋白质组学
4D-label free 定量蛋白质组学

iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,进行LC-MS/MS分析,可同时比较多种不同样本中蛋白质的相对表达含量。

实验流程:
*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析,对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断。
应用方向:
技术优势:

生物领域各个研究方面,如:


 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;


 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;


 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;


 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等。

 具有2-8 plex标签,可同时标记2-8组样本进行表达差异分析;


 是一种体外标记技术,可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本;


 不同标签混合后上机,具有较好的平行性,避免技术误差,提高检测效率;


 与凝胶方法相比,iTRAQ可发现膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、强碱和强酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白质,对低丰度蛋白质亦有较好的检出率。

据分析:


标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图

差异蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析内容

WGCNA共表达分析

获得与表型强关联的核心蛋白质

趋势聚类分析

探讨蛋白质的表达趋势模式