4D-琥珀酰化修饰蛋白质组学

蛋白质琥珀酰化（Succinylation）修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式，是通过酶活性催化和非酶活性催化两种方式，将琥珀酰基供体上的琥珀酰基团结合到蛋白质赖氨酸残基的过程。发生酰化修饰的氨基酸上可共价连接琥珀酰，其分子质量会相应增加100.01Da。质谱能够精确地测定分子量是否发生相应的质量偏移，实现酰化修饰肽段及位点的分析。 赖氨酸琥珀酰化修饰能够引起蛋白质较大的质量变化（100.01 Da），且赖氨酸琥珀酰化修饰能诱导电荷突变（+1至－1），因此赖氨酸琥珀酰化修饰能够产生更大的结构变化和电荷变化，在调控蛋白质结构和核心能量代谢功能（包括三羧酸循环、糖代谢等）方面发挥着重要作用，对线粒体失调、代谢紊乱相关疾病的研究具有重要价值。 4D-label free琥珀酰化修饰蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行琥珀酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。