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RNA PullDown

原理:靶向RNA回收技术是上海泽恒生物科技有限公司的一种改进型RNA pulldown技术,其原理主要是利用生物素标记的探针与细胞内的目的 RNA 杂交,再利用链霉亲和素磁珠与生物素基团的互作捕获探针-RNA 复合体。此后,将所捕获的复合体中的 RNA 以及与 RNA 所结合的 miRNA、蛋白质、DNA 纯化出来,最后通过 qPCR 芯片、测序和质谱检测等方式鉴定纯化得到的 miRNA、DNA、蛋白质。

应用:

1.研究RNA-miRNA相互作用:如果目的RNA位于胞浆,该技术用于寻找目的RNA上真实结合的miRNA,适合研究mRNA、lncRNA、circRNA上结合的miRNA,非常适合通过ncRNA-miRNA-mRNA说明ncRNA的作用机制。

2. 研究RNA-蛋白质相互作用:如果目的RNA位于胞浆或者胞核,该技术用于寻找目的RNA上真实结合的蛋白质,适合研究mRNA、lncRNA、circRNA上结合的蛋白质,非常适合研究ncRNA-蛋白质相关作用进而影响信号通路、基因表达等相关机制研究。

3. 研究RNA-DNA相互作用:如果目的RNA位于胞核内,该技术用于检测目的RNA在细胞核中和染色体DNA的相互作用,适合研究mRNA、lncRNA、circRNA与DNA的相互作用,非常适合研究ncRNA在细胞核中如何通过靶向调控基因表达的相关机制研究。