原理：染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白质结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

应用：

ChIP方法能研究DNA甲基化、染色质结构、组蛋白修饰和转录因子的协同结合，或者从预测的靶基因中确定直接的靶位点。ChIP技术和其它分子生物学技术结合（例如普通PCR，实时定量PCR，基因克隆，DNA微阵列或者更直接的高通量测序技术），已经被用于确定转录因子和DNA的相互作用或转录因子新的基因组靶位点。

最初，ChIP应用于哺乳动物、酵母、果蝇染色质的研究上；后来，被应用在相关转录因子和修饰后组蛋白位置等方面的研究方面。ChIP技术还能用于研究蛋白和蛋白之间的相互作用，如通过酵母双杂交和ChIP证实了DELLA蛋白与PIF3蛋白之间的相互作用。

随着ChIP技术的进一步完善，它必将会在基因表达调控研究中发挥越来越重要的作用。而由于ChIP实验涉及的步骤多，结果的重复性较低，因此研究人员对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照，而且对结果的分析也需要有一定的经验。对刚刚开始使用ChIP技术的实验新手，选用成熟的商品化试剂盒和相关的技术服务可达到事半功倍的效果。