◆ 无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短；

◆ 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较；

◆ 克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便。

生物领域各个研究方面，如：

◆ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

◆ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

◆ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

◆ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。